细胞培养的“致命缺陷”正在被取代?合成生物学的终极解决方案
细胞培养的“致命缺陷”正在被取代?合成生物学的终极解决方案

从第一款重组蛋白药物上市到如今CAR-T细胞疗法治愈癌症,现代生物制药的发展脚步,始终踩着细胞培养技术升级的节拍。半个多世纪以来,科学家们依靠体外细胞培养完成药物筛选、蛋白生产、毒性测试等一系列核心工作,可以说没有细胞培养技术,就没有今天蓬勃发展的生物医药产业。但随着研究的深入,细胞培养与生俱来的“致命缺陷”正在成为行业发展的瓶颈——从细胞系遗传漂变到环境依赖,从产物得率低到安全性风险,越来越多的研发瓶颈倒逼整个行业寻找全新出路。如今,合成生物学的快速发展,正在为这些难题提供终极解决方案,一场替代传统细胞培养的技术革命已经悄然拉开序幕。
传统细胞培养最核心的致命缺陷,其实藏在我们最熟悉的地方:活细胞本身就是一个复杂的“黑箱”。我们把目标基因放到活细胞里表达,不仅要维持细胞的存活生长,还要对抗细胞自身的代谢调控,甚至要担心细胞突变、微生物污染这些不可控风险。具体来说,传统细胞培养的痛点至少戳中了行业发展的三个要害:第一是遗传稳定性差,无论是永生化细胞系还是原代细胞,长期体外培养都会发生基因突变和表型漂移,尤其是工业生产用细胞,传代几十次之后,蛋白表达量就会明显下降,产物质量也参差不齐,给大规模生产带来极大的质量控制压力;第二是成本与产能瓶颈,细胞培养对培养环境、营养液、无菌条件要求极高,一套大型生物反应器系统造价不菲,培养过程的能耗、物耗都很高,而且培养周期长,产能扩张慢,遇到突发公共卫生事件需要快速扩产疫苗的时候,往往会面临产能不足的困境;第三是安全性风险,动物源血清可能携带病毒、支原体等病原体,虽然有严格的纯化工艺,但仍然存在潜在的安全隐患,而异源蛋白残留也可能引发人体免疫反应,这些风险从细胞培养技术诞生起就一直没有彻底解决。
更关键的是,当合成生物学把细胞改造成“细胞工厂”生产各种化合物的时候,传统活细胞培养的缺陷被进一步放大。为了让细胞生产我们需要的目标产物,往往需要给细胞插入多条外源基因的代谢通路,这些异源通路会给细胞带来极大的代谢负担,导致细胞生长缓慢,甚至活力下降,最终产物得率远低于预期,很多设计很好的合成通路最终都卡在了细胞培养这一步,无法实现产业化。传统细胞培养的这套体系,已经跟不上合成生物学工程化、规模化、低成本的发展需求,行业迫切需要一套能够绕过活细胞培养缺陷的全新方案。
而无细胞合成生物学体系,正是合成生物学给细胞培养致命缺陷开出的终极解决方案。所谓无细胞合成生物学,简单来说就是把细胞中的大分子元件——比如核糖体、转录酶、代谢因子这些核心的生物合成元件提取出来,在试管里重构蛋白质合成、代谢通路运转的过程,不需要维持活细胞的存活生长,从根源上绕开了活细胞培养的所有缺陷。它没有细胞生长的代谢负担,可以轻松承载多条复杂的异源合成通路,产物得率比活细胞培养更高;没有遗传漂变的问题,体系组成完全可控,产物质量均一性更好,质量控制也更简单;不需要严格的无菌培养条件,不需要昂贵的生物反应器,生产周期短,产能扩张非常灵活,成本也比传统细胞培养低很多。更重要的是,无细胞体系完全不涉及活细胞改造的安全伦理问题,也不存在活细胞泄漏到环境中的潜在风险,安全性比传统细胞培养高了一个量级。
近年来,无细胞合成生物学的发展速度远超预期,已经从实验室研究走向了产业化应用。最典型的就是疫苗生产,新冠疫情期间,无细胞合成蛋白质技术已经成功用来快速生产mRNA疫苗的核心蛋白,整个生产过程只需要几天时间,远远快于传统活细胞培养生产疫苗的几个月,而且不需要扩增病毒,安全性更高,产能扩张也更快。在蛋白药物生产领域,无细胞体系可以高效生产很多活细胞很难表达的复杂蛋白,比如含有多个二硫键的抗体药物、毒性蛋白,解决了很多活细胞培养解决不了的表达难题。在合成生物学打造“细胞工厂”生产化学品领域,无细胞合成体系已经可以实现从葡萄糖到乳酸、到聚乳酸的全合成通路,不仅效率比活细胞工厂更高,而且分离提纯更简单,成本更低,现在已经有不少企业开始用无细胞体系大规模生产小分子药物中间体和可降解材料,产业化落地速度正在不断加快。
除了无细胞体系之外,合成生物学也在从另一个方向改造传统细胞培养,解决它的致命缺陷。通过基因编辑技术对底盘细胞进行全基因组改造,敲除细胞中不必要的基因,减少代谢负担,提高遗传稳定性,现在科学家已经构建出了一系列全新的人工合成底盘细胞,这些细胞的遗传稳定性远远优于传统细胞系,蛋白表达量更高,不容易发生突变,已经广泛用来生产重组蛋白、抗体药物等产品。还有的科学家通过合成生物学改造酵母、大肠杆菌这些微生物底盘,替代传统的哺乳动物细胞培养,不仅培养成本更低,生长更快,而且更容易实现高密度发酵,产物得率更高,现在很多胰岛素、抗体片段都已经通过微生物底盘实现了大规模生产,成本只有传统哺乳动物细胞培养的几十分之一。
当然,我们说合成生物学正在提供终极解决方案,并不意味着传统细胞培养会立刻退出历史舞台。传统细胞培养经过几十年的发展,已经形成了非常成熟的工艺体系,在很多领域依然有着不可替代的优势,比如原代细胞的药物筛选、干细胞治疗的细胞制备,这些领域依然需要传统细胞培养技术。而合成生物学带来的新体系,目前也还存在一些需要完善的地方,比如无细胞体系的大规模生产中,大分子元件的成本还比较高,长代谢通路的效率还需要进一步提升。但不可否认的是,合成生物学已经找到了绕过传统细胞培养致命缺陷的方向,随着技术的不断成熟,新体系的成本会不断下降,效率会不断提升,未来一定会在越来越多的领域替代传统细胞培养。
从细胞培养技术诞生到今天,整个生物医药行业一直在和活细胞的不可控性做斗争,而合成生物学带来的改变,本质上是把生物合成从复杂的活细胞黑箱,变成了可以人工设计、人工控制的工程化体系——我们不再需要迁就活细胞的生长需求,不再需要为活细胞的不可控突变买单,而是可以按照我们的需求,从头设计搭建生物合成体系,这本身就是合成生物学“设计生命、改造生命”的核心魅力所在。未来随着合成生物学技术的进一步成熟,我们一定会看到更多更高效、更安全、更低价的生物制药产品走进临床,惠及更多患者,而这正是技术进步给人类健康带来的最珍贵馈赠。


